GPU 加速高性能计算经典应用在线研讨会上线,第一场聚焦分子动力学和材料电子结构计算!

高性能计算在重大科学发现的前沿基础科学研究领域已逐渐成为不可或缺的重要手段之一。从分子动力学模拟、生物制药、材料电子结构计算、材料模拟到生命科学,都离不开高性能计算的支持。

高性能计算和科学计算的过程往往伴随着庞大的数据量以及高计算力需求,也诞生了一些面向不同领域的应用软件,比如 LAMMPS、GROMACS、VASP 和 NAMD 等,能够帮助科学家跨领域开展工作,加快科学发现速度。

这些应用软件都针对 GPU 进行了专门优化,同时可以借助 CUDA、OpenACC 和 GPU 加速的数学库来提升运行效率。因此,科学家可以利用 GPU 实现更快的结果,同时大幅减少编程工作量。有实践表明,针对分子动力学、量子化学、生命科学等前沿基础科学研究,代码在 GPU 上的运行速度将能提升3~10倍。

如何将高性能计算和科学计算应用软件更好地部署到 GPU 计算平台,并针对其计算特点进行优化,实现在 GPU 计算平台的高效运行是科学家开展工作的关键一步。

5月起,智东西公开课与 NVIDIA 共同策划推出「GPU 加速高性能计算(HPC)经典应用在线研讨会」。研讨会将聚焦经典高性能计算和科学计算应用,以及如何在 GPU 平台更好地加速这些应用。

「GPU 加速高性能计算(HPC)经典应用在线研讨会」计划开设两场。5月26日,研讨会第一场将以直播形式举行,重点探讨应用于分子动力学和材料电子结构计算的三大软件:LAMMPS、GROMACS 和 VASP。

NVIDIA(英伟达)高级系统架构师易成、解决方案架构师戴志翔和解决方案架构师马四腾三位技术专家将分别以《GPU 加速 LAMMPS 分子动力学应用》、《GROMACS 使用及优化方法》、《GPU 加速 VASP 应用》为主题进行分享。

研讨会将在智东西公开课知识店铺进行视频直播,从下午13:30开始,持续到16:15。其中,16:00-16:15为问答环节,三位主讲人将在线答疑。

GPU 加速高性能计算经典应用在线研讨会上线,第一场聚焦分子动力学和材料电子结构计算!

主题介绍

1、易成,英伟达高级系统架构师:《GPU 加速 LAMMPS 分子动力学应用》

LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是一款经典的分子动力学计算软件,常用于原子、分子或连续介质的粒子模拟,可用于固体材料(金属、半导体等)、软物质(生物分子、聚合物等)、粗粒度或介观系统的模拟。LAMMPS 支持单节点计算或通过 MPI 进行大规模集群并行计算,可以很好地支持 GPU 加速并行计算。

本次研讨会将重点讲解 LAMMPS 对 GPU 的支持情况、LAMMPS 的编译和运行方式。

2、戴志翔,英伟达解决方案架构师:《GROMACS 使用及优化方法》

GROMACS(Groningen Machine for Chemical Simulations)是一整套分子动力学模拟功能程序包,广泛用于蛋白质、脂质、DNA 及 RNA 等生物分子的性质模拟研究。

本次研讨会将对 GROMACS 的安装和使用流程进行介绍,并对 GROMACS 对 GPU 的支持情况、不同算例对 GPU 的算力需求,以及多 GPU 运行的优化方法等进行深入讲解。

3、马四腾,英伟解决方案架构师:《GPU 加速 VASP 应用》

VASP 是目前材料微观反应机理和计算材料电子结构性质科学研究中最流行的一款软件。本次研讨会将从 VASP 新版本对 GPU 的支持情况、如何在 GPU 平台上安装与运行 VASP,以及 VASP 在 GPU 平台上的性能表现等方面进行系统讲解,让大家了解如何在 GPU 平台上更好地运行 VASP 软件。

报名方式

对本次研讨会感兴趣的朋友,可以扫描下方二维码,添加小助手瑞秋进行报名。已添加过瑞秋的老朋友,可以给瑞秋私信,发送“HPC01”即可报名。

同时,为了方便大家交流和咨询,针对「GPU 加速高性能计算(HPC)经典应用在线研讨会」还设置了专属交流群,将会邀请主讲人加入。希望加入交流群与主讲人直接认识和交流的朋友,也可以向瑞秋进行申请。

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